Макарьич

О кластере

Вычислительный комплекс "Макарьич" Лаборатории эволюционной геномики назван в честь выдающегося российского учёного Альберта Макарьевича Молчанова, умершего летом 2011 г.

Ресурсы кластера используются для хранения и обработки данных высокопроизводительного секвенирования как сотрудниками лаборатории, так и сотрудниками, аспирантами и студентами других подразделений МГУ: Факультета биоинженерии и биоинформатики, НИИ Физико-Химической Биологии и Биологического факультета МГУ.

Физически кластер размещен на Факультете биоинженерии и биоинформатики МГУ им М.В. Ломоносова.

Получить доступ

Мы открыты к коллаборациям и готовы, при необходимости, предоставить вычислительные ресурсы. Регистрация

Характеристики кластера

Головные узлы:

  • 2 узла для доступа и управления кластером, сборки ПО (HP)

Вычислительные узлы:

  • 30 узлов общего назначения (24 ядра, 48Гб оперативной памяти) (Intel)
    • 2 узла оснащены GPUGPU Nvidia GTX1060
    • 3 узла с увеличенным объемом памяти (32 ядра, 128Гб оперативной памяти) (Supermicro)
    • 3 узла для сборки геномов
      • 48 ядер и 512Гб оперативной памяти (HP)
      • 80 ядер, 1Тб и 2Тб оперативной памяти (Supermicro)

Система хранения:

  • Основная иерархическая файловая система (Lustre) 330Tб
  • Хранилища для данных секвенирования (NFS, Samba) 60Тб
  • Хранилище холодных данных (NFS) 60Тб
  • Сервера хранения:
    • 2 управляющих сервера (HP, Supermicro)
    • 4 сервера данных (HP, Supermicro)
    • 4 системы хранения данных (Maxtronic)
    • Стример HP StoreEver LTO-6 Ultrium 6250

Сеть:

  • 1G Ethernet: 3Com, HP
  • 8G FC: QLogic

ИБП:

  • основной ибп для кластера - APC Smart-UPS VT 40KVA
  • ибп для высокопроизводительных секвенаторов - Eaton 9px 5000i

ПО:

  • ОС:
    • Scientific Linux 6.8 (основная)
    • Ubuntu 16.04 (сервер виртуализации)
  • Управление очередью задач: Torque/PBS
  • Мониторинг: Nagios + Thruk
  • Оркестрирование: Puppet, Ansible
  • Инвентаризация/хэлпдеск: GLPI
  • Виртуализация: Docker
  • Прочая классика:
  • MySQL
  • Apache
  • Squid

Служебные сервисы:

Веб-сервисы:

Контакты:

Адрес: 119234, г. Москва, Ленинские Горы 1 с 73, Факультет биоинжненерии и биоинформатики