Макарьич
О кластере
Вычислительный комплекс "Макарьич" Лаборатории эволюционной геномики назван в честь выдающегося российского учёного Альберта Макарьевича Молчанова, умершего летом 2011 г.
Ресурсы кластера используются для хранения и обработки данных высокопроизводительного секвенирования как сотрудниками лаборатории, так и сотрудниками, аспирантами и студентами других подразделений МГУ: Факультета биоинженерии и биоинформатики, НИИ Физико-Химической Биологии и Биологического факультета МГУ.
Физически кластер размещен на Факультете биоинженерии и биоинформатики МГУ им М.В. Ломоносова.
Получить доступ
Мы открыты к коллаборациям и готовы, при необходимости, предоставить вычислительные ресурсы. Регистрация
Характеристики кластера
Головные узлы:
- 2 узла для доступа и управления кластером, сборки ПО (HP)
Вычислительные узлы:
- 30 узлов общего назначения (24 ядра, 48Гб оперативной памяти) (Intel)
- 2 узла оснащены GPUGPU Nvidia GTX1060
- 3 узла с увеличенным объемом памяти (32 ядра, 128Гб оперативной памяти) (Supermicro)
- 3 узла для сборки геномов
- 48 ядер и 512Гб оперативной памяти (HP)
- 80 ядер, 1Тб и 2Тб оперативной памяти (Supermicro)
Система хранения:
- Основная иерархическая файловая система (Lustre) 330Tб
- Хранилища для данных секвенирования (NFS, Samba) 60Тб
- Хранилище холодных данных (NFS) 60Тб
- Сервера хранения:
- 2 управляющих сервера (HP, Supermicro)
- 4 сервера данных (HP, Supermicro)
- 4 системы хранения данных (Maxtronic)
- Стример HP StoreEver LTO-6 Ultrium 6250
Сеть:
- 1G Ethernet: 3Com, HP
- 8G FC: QLogic
ИБП:
- основной ибп для кластера - APC Smart-UPS VT 40KVA
- ибп для высокопроизводительных секвенаторов - Eaton 9px 5000i
ПО:
- ОС:
- Scientific Linux 6.8 (основная)
- Ubuntu 16.04 (сервер виртуализации)
- Управление очередью задач: Torque/PBS
- Мониторинг: Nagios + Thruk
- Оркестрирование: Puppet, Ansible
- Инвентаризация/хэлпдеск: GLPI
- Виртуализация: Docker
- Прочая классика:
- MySQL
- Apache
- Squid
Служебные сервисы:
- http://ma.fbb.msu.ru/thruk - панель мониторинга nagios
- http://ma.fbb.msu.ru/glpi - инвентаризация и helpdesk
- http://ma.fbb.msu.ru/filestat - использованием пользователями основной ФС Lustre
- http://ma.fbb.msu.ru/torque - состояние очереди задач
- http://ma.fbb.msu.ru/glpi - панель мониторинга nagios
Веб-сервисы:
- RStudio (R version 3.6.3)
- RStudio-beta (R version 4.1.0)
- Jupyter
- Sequenceserver
- TravaDB
Контакты:
Адрес: 119234, г. Москва, Ленинские Горы 1 с 73, Факультет биоинжненерии и биоинформатики